Отправьте статью сегодня! Журнал выйдет ..., печатный экземпляр отправим ...
Опубликовать статью

Молодой учёный

Анализ хромосом и размера генома хозяйственно-ценных видов рода Allium L.

Научный руководитель
Биология
25.07.2024
70
Поделиться
Библиографическое описание
Баева, А. В. Анализ хромосом и размера генома хозяйственно-ценных видов рода Allium L. / А. В. Баева, Ф. А. Пивоваров, М. А. Васильева, М. В. Скапцов. — Текст : непосредственный // Юный ученый. — 2024. — № 8 (82). — С. 18-20. — URL: https://moluch.ru/young/archive/82/4596/.


В статье авторы исследовали генетические особенности лука репчатого, лука-батуна, лука клубненосного, а именно количество и структуру хромосом, уровень плоидности, количество и содержание ДНК. Произведён расчет размера генома исследованных видов и размера их хромосом. Наименьший размер генома характерен для лука Батуна (24,34 млрд. пар нуклеотидов). Самый большой геном у лука клубненосного (62,24 млрд. пар нуклеотидов).

Ключевые слова: Allium, плоидность, хромосома, цитометрия, размер генома.

Род Allium L. (Лук) — представляет двулетние и многолетние травянистых растений. По современной классификации относится к подсемейству луковые, семейства амариллисовые порядка спаржецветные. По всему миру распространено более 900 видов лука рода Allium виды рода произрастают в луговых, степных и лесных экосистемах [1]. Представители рода используются человеком в пищевых, декоративных и лекарственных целях. Многие виды луков культивируются в связи со своими вкусовыми и ароматическими качествами. Практически все виды можно использовать в пищу в свежем и обработанном виде. Виды рода повсеместно используются в декоративных целях, в ландшафтном дизайне и озеленении. Некоторые виды используются в лекарственных целях и народной медицине, при лёгочных заболеваниях, в фармацевтике и косметологии. Содержат в своем составе витамины, полифенолы, флавоноиды и другие полезные соединения, а также проявляют антиоксидантную активность [2, 3]. Одними из самых распространенных видов лука, зелёная часть которых используется в пищу являются: лук репчатый, лук-батун и лук клубненосный (джусай). Данные виды в виде зелени встречаются в повседневной жизни и на приусадебных участках.

Лук репчатый один из самых распространённых видов лука, используемых человеком. Выведено очень много сортов, используемых по всему миру. У лука-батуна в пищу используется чаще используются листья или все растение. Лук клубненосный более распространён в странах Азии в России менее известен. Используется в виде декоративных растений, в качестве ароматизатора и традиционной медицине. В кулинарии применим в связи со своим чесночным ароматом. В большинстве случаем обычные потребители не отличают данные виды принимая это за один вид — зелёный лук. Целью нашего исследования являются исследования плоидности количества хромосом и размера генома лука репчатого, лука-батуна и лука клубненосного.

Материалы и методы.

Для определения содержания ДНК использовали метод проточной цитометрии с окрашиванием йодидом пропидия. В качестве образцов использовали свежие листья. Образцы измельчали вместе со стандартом с использованием лезвий в буфере Tris-MgCl, дополненном йодидом пропидия (50 мкг/мл), РНКазой (10 мкг/мл) и 2-меркаптоэтанолом (0,2 %) [4]. Анализы проводили на цитометре Partec CyFlow PA. В качестве внутреннего стандарта использовали Pisum sativum с содержание ДНК 2C = 9,09 пг и Vicia faba с содержание ДНК 2C = 26,9 пг [5]. Прямой подсчет хромосом проводили методом давленных препаратов с окрашиванием 1 %-ным ацетоорсеином. После этого окрашенные кончики корней срезали и раздавливали в капле 45 % уксусной кислоты. Метафазные пластинки наблюдали и фотографировали с помощью микроскопа Carl Zeiss Axio Imager A2.

Результаты

В результате исследования нами проанализирован размер генома и количество хромосом видов A. cepa , A. fistulosum и A. tuberosum представленные в таблице 1.

Таблица 1

Содержание ДНК, размер генома и уровень плоидности исследованных видов лука

Вид

2C, пг

SD, пг

CV, %

1C, Gbp

x

2n

2C/ 2 n

Allium tuberosum Spreng.

63,644

0,308

0,48 %

62,24392

4

32

1,989

Allium cepa L.

33,626

2,609

7,76 %

32,88585

2

16

2,102

Allium fistulosum L.

24,881

0,657

2,64 %

24,33398

2

16

1,555

По нашим данным лук репчаты является диплоидом с количеством хромосом 2n = 16 и содержанием ДНК 2С = 33,626 пг. Лук батун является диплоидом с количеством хромосом 2n = 16 и содержанием ДНК 2С = 24,881 пг. Лук клубненосный является тетраплоидом с количеством хромосом 2n = 32 и содержанием ДНК 2С = 63,664 пг. Примеры гистограмм и набора хромосом представлены на рис. 1.

Примеры гистограмм и препаратов хромосом. А — Allium fistulosum; Б — Allium cepa; В — Allium tuberosum

Рис. 1. Примеры гистограмм и препаратов хромосом. А — Allium fistulosum ; Б — Allium cepa ; В — Allium tuberosum

Тем самым, данные виды луков отличаются друг от друга количеством хромосом, уровнем плоидности и размером генома. Различия в размере генома связаны с уровнем плоидности и длинной хромосом. На что указывает средней размер хромосомы в пикограммах (2С/2n). Несмотря на внешнюю схожесть зелёной части данные виды луков значительно различаются генетически. Наиболее эффективным методом разграничения данных видов является метод проточной цитометрии.

Благодарности

Исследования проведены на базе Алтайского государственного университета в ходе школьного научного лагеря BioCamp.

Литература:

1. Allium // [Электронный ресурс] The Plant List. URL: http://www.theplantlist.org/1.1/browse/A/Amaryllidaceae/Allium (дата обращения: 19.07.2024).

2. Манукян К. А., Айрапетова А. Ю., Шаталова Т. А. Получение и исследование антиоксидантной активности экстрактов листьев лука медвежьего и лука победного // The Journal of scientific articles «Health and Education Millennium», 2017, Т. 19, № 3, p. 150–153.

3. Безматерных К. В., Ширшова Т. И., Бешлей И. В., Матистов Н. В., Смирнов Г. В., Октябрьский О. Н., Володин В. В. Оценка антиоксидантной активности экстракта Allium schoenoprasum L. и Rubus chamaemorus L. произрастающих в Республике Коми // Химико-фармацевтический журнал, 2014, Т. 48, № 2, с. 36–40.

4. Pfosser M., Heberle-Bors E., Amon A., Lelley T. Evaluation of sensitivity of flow-cytometry in detecting aneuploidy in wheat using disomic and ditelosomic wheatrye addition lines // Cytometry, 1995, № 21, р. 387–393.

5. Doležel J., Sgorbati S., Lucretti S. Comparison of three DNA fluorochromes for flow cytometric estimation of nuclear DNA content in plants // Physiologia Plantarum, 1992, № 85, p. 625–631.

Можно быстро и просто опубликовать свою научную статью в журнале «Молодой Ученый». Сразу предоставляем препринт и справку о публикации.
Опубликовать статью
Ключевые слова
Allium
плоидность
хромосома
цитометрия
размер генома

Молодой учёный